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生信分析服务介绍

七师兄 生信之家 2022-05-10

生物信息是一种综合性的学科,也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系,通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容

我们需要“强强联合”,把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务,可以节省时间、提高质量。


  1.  如果有目标基因,那么我们可以协助进行分析,得到逻辑的创新的基因与疾病关联依据。提供国自然前期研究基础的理论依据。
     

  2. 如果没有靶标基因,那么我们可以协助进行数据挖掘,筛选关键靶标基因与靶标通路。提供国自然前期研究基础的理论依据。


【医药加】项目合作
研究方向解决问题分析内容
非编码RNA_circRNA及lncRNA相关1.  如果有目标基因,那么我们可以协助进行分析,得到逻辑的创新的基因与疾病关联依据。提供国自然前期研究基础的理论依据。
   2. 如果没有靶标基因,那么我们可以协助进行数据挖掘,筛选关键靶标基因与靶标通路。提供国自然前期研究基础的理论依据。
数据来源:(1)基于自己样本的测序数据、芯片数据或质谱数据等高通量数据进行生信高级挖掘;
   (2) 基于公共数据库(TCGA, GEO, ICGC, CGGA, SRA等)的高通量数据进行生信高级挖掘;
   分析内容:(1) 基于客户提供目标基因与疾病,进行单基因生信分析,提供该基因与疾病的逻辑关联依据。
   (2)基于高通量数据进行生信挖掘,获得结论,为客户提供关键靶标基因或靶标通路目标。
ceRNA相关
m6A RNA甲基化相关
单细胞相关
外泌体囊泡相关
多组学相关
铁死亡相关
自噬、焦亡、坏死相关
肠道菌群相关
癌症靶标相关
网络药理学相关

                                可扫码详细咨询医药加范老师



定制化数据分析内容展示

类别

分析项目

分析内容

单组学高通量高级分析

(基于已有的标准分析结果,添加高级分析)

转录组学:lncRNA、miRNA、mRNA、circRNA测序/芯片数据。

基因组学:全基因组测序、外显子测序/芯片数据。

表观组学:DNA或RNA甲基化测序/芯片数据。

蛋白组学:ITRAQ质谱数据。

代谢组学:GC-MS,LC-MS,NMR

宏基因组学:16s测序、宏全基因组测序数据。

差异表达基因筛选;

无监督聚类的PCA或HeatMap分析;

有监督聚类的OPLS-DA分析;

基因上下游调控预测(miRNA,TF);

VENN图分析;

蛋白与蛋白互作网络分析;

WGCNA模块分析;

基因相关性分析;

lncRNA(circRNA)与mRNA共表达分析及网络构建;

关键lncRNA(circRNA)或miRNA功能分析;

竞争内源RNA(ceRNA)预测;

多组样本不同时间(浓度)递增数据分析;

筛选关键基因(lncRNA、circRNA或mRNA);

GSEA富集分析;

生存预后分析;





基于公共数据库的高级分析。

基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测(miRNA, lncRNA, mRNA)和通路功能筛选。

多套数据整合分析.

多组学整合分析(基于标准分析结果,添加高级分析)

全转录组整合分析;

转录组与蛋白组整合分析;

蛋白组与代谢组整合分析;

基因组与转录组整合分析;

表观组与转录组整合分析;

个性化定制分析(想法帮你实现)

根据需求做图、做表;

基于参考文献思路进行生信分析;

基于客户制定的分析思路进行生信分析。

中药/单体网络药理学分析

中草药单体成分分析及有效成分预测

药物单体靶标蛋白预测及功能分析

药物功能网络药理学分析



关于我们

宋伟博士服务团队

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发,每年为科研院所的几百个生信分析项目提供高级分析服务。


研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。


生信高级分析服务评估咨询:医药加范老师, 15301721511 (手机,微信号)



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