生信分析服务介绍
生物信息是一种综合性的学科,也是一门工具。它与临床医学、动植物学、微生物学等方向有这密切的联系,通过生信分析可以——获得理论或基础的结论、指导实验方向和丰富文章内容。
我们需要“强强联合”,把各自擅长的领域联合——研究方向领域基础+生信高级分析。个性的分析服务,可以节省时间、提高质量。
如果有目标基因,那么我们可以协助进行分析,得到逻辑的创新的基因与疾病关联依据。提供国自然前期研究基础的理论依据。
如果没有靶标基因,那么我们可以协助进行数据挖掘,筛选关键靶标基因与靶标通路。提供国自然前期研究基础的理论依据。
【医药加】项目合作 | ||
研究方向 | 解决问题 | 分析内容 |
非编码RNA_circRNA及lncRNA相关 | 1. 如果有目标基因,那么我们可以协助进行分析,得到逻辑的创新的基因与疾病关联依据。提供国自然前期研究基础的理论依据。 2. 如果没有靶标基因,那么我们可以协助进行数据挖掘,筛选关键靶标基因与靶标通路。提供国自然前期研究基础的理论依据。 | 数据来源:(1)基于自己样本的测序数据、芯片数据或质谱数据等高通量数据进行生信高级挖掘; (2) 基于公共数据库(TCGA, GEO, ICGC, CGGA, SRA等)的高通量数据进行生信高级挖掘; 分析内容:(1) 基于客户提供目标基因与疾病,进行单基因生信分析,提供该基因与疾病的逻辑关联依据。 (2)基于高通量数据进行生信挖掘,获得结论,为客户提供关键靶标基因或靶标通路目标。 |
ceRNA相关 | ||
m6A RNA甲基化相关 | ||
单细胞相关 | ||
外泌体囊泡相关 | ||
多组学相关 | ||
铁死亡相关 | ||
自噬、焦亡、坏死相关 | ||
肠道菌群相关 | ||
癌症靶标相关 | ||
网络药理学相关 |
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定制化数据分析内容展示
类别 | 分析项目 | 分析内容 |
单组学高通量高级分析 (基于已有的标准分析结果,添加高级分析) | 转录组学:lncRNA、miRNA、mRNA、circRNA测序/芯片数据。 基因组学:全基因组测序、外显子测序/芯片数据。 表观组学:DNA或RNA甲基化测序/芯片数据。 蛋白组学:ITRAQ质谱数据。 代谢组学:GC-MS,LC-MS,NMR 宏基因组学:16s测序、宏全基因组测序数据。 | 差异表达基因筛选; 无监督聚类的PCA或HeatMap分析; 有监督聚类的OPLS-DA分析; 基因上下游调控预测(miRNA,TF); VENN图分析; 蛋白与蛋白互作网络分析; WGCNA模块分析; 基因相关性分析; lncRNA(circRNA)与mRNA共表达分析及网络构建; 关键lncRNA(circRNA)或miRNA功能分析; 竞争内源RNA(ceRNA)预测; 多组样本不同时间(浓度)递增数据分析; 筛选关键基因(lncRNA、circRNA或mRNA); GSEA富集分析; 生存预后分析; |
基于公共数据库的高级分析。 | 基于TCGA/GEO/SRA/EBI数据库做癌症靶标预测(miRNA, lncRNA, mRNA)和通路功能筛选。 多套数据整合分析. | |
多组学整合分析(基于标准分析结果,添加高级分析) | 全转录组整合分析; 转录组与蛋白组整合分析; 蛋白组与代谢组整合分析; 基因组与转录组整合分析; 表观组与转录组整合分析; | |
个性化定制分析(想法帮你实现) | 根据需求做图、做表; 基于参考文献思路进行生信分析; 基于客户制定的分析思路进行生信分析。 | |
中药/单体网络药理学分析 | 中草药单体成分分析及有效成分预测 药物单体靶标蛋白预测及功能分析 药物功能网络药理学分析 |
关于我们
宋伟博士服务团队
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发,每年为科研院所的几百个生信分析项目提供高级分析服务。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
生信高级分析服务评估咨询:医药加范老师, 15301721511 (手机,微信号)